整个朝廷和皇帝如同对决一般，都推到了风口浪尖上，只等时间一到，皇帝便会像改革内廷一样改革朝政。
朝臣能斗得过皇帝吗？方从哲自嘲一番，皇上是咱从小看着长大的，那种雄才伟略早就凸显无疑，上一次大臣们罢朝逼迫皇帝，下次再来一次还有效吗？自古民不和官斗，臣不和君斗，这都是千古明训，若再来一次，恐怕都得掉脑袋。
圣君者，天意难测啊！
放弃吧！
方从哲不敢想象自己的将来是什么样的后果，现在回家养老是功成名就，别等到以后身败名裂。于是，方从哲提笔写了一份辞呈，告老还乡。
朝野为之一震。方从哲的突然举动让朝野们错愕惊然，事先一点消息都没透露，这让人很意外。朱由校接到方从哲的辞呈，淡淡一笑，拿起御笔在折子上批示“不准”，并好言相劝挽留。方从哲的辞呈没有批复，继而接二连三的上折子请求告老还乡，朱由校仍是不予批复，还派人嘉奖他为政有功于社稷，正直朝廷危难之际，不可弃君而去，应消防古之圣贤，鞠躬而尽瘁。
朱由校还通晓六部，以示恩宠。
各部官员们都十分焦急，首辅就是百官的领袖，他们正和皇帝的政见不一，方从哲一旦致士，他们就像群龙无首一般，皇帝还不想怎样就怎样，到时候大刀阔斧的一改革，他们谁又能力出来阻止？皇帝对方从哲有点忌惮，对他么你这些大臣可不忌惮！
百官们快把他门家的门槛踏破了，后来都闭门不见，官员们就到内阁去找他劝说。
面对百官们的规劝，方从哲暗叹他们不知鸿鹄之志，不知大祸临头还在安享太平，还沉寂在上次的胜利之中。上次与皇帝相争虽堪称文官完胜，未有一人被罢官遭贬，为大明历年来最大的一次与皇帝的抗争胜利，但皇帝终究是皇帝，臣子终究是臣子，皇帝始终掌握生死大权！
内阁里，方从哲忧心忡忡，大臣们挤在一块你一言我一语的劝说方从哲打消辞官的念头，而方从哲眉头紧皱不言语，次辅韩爌也是在旁规劝。官员们都如热锅上的蚂蚁，脸上也如方从哲一般，眉头紧皱，煞是焦急，只等方从哲撂出一句话。方从哲只是摇头不语，整整一个上午，大臣们都在内阁苦苦相劝，说只要首辅辞官，我们也辞官之类的话，想以此打动首辅。
近晌午十分，面对百官的言语，方从哲起身轻轻甩手，终于开口说了一句话，“大家都散了吧，容老夫斟酌斟酌。”
首辅既然说话了，也就没什么好说的了，都晌午了，废了这么多的口舌，也都口干舌燥肚子饿，该回去吃饭的吃饭，该去喝茶的喝茶，慢慢的官员们都悻悻的离开了，次辅韩爌也去吃饭了。
方从哲叹气的坐在位置上长吁短叹，整个内阁只有留下了自己在静静的沉思。片刻后，感到肚子有点饿了，准备起身去吃饭，刚一站起来抬脚要往外走，忽然发现墙角边上还站着一个人，着实把方从哲吓了一跳。见到方从哲看向他，鞠躬行礼，“下官参见首辅大人。”
方从哲定睛打量了这个让人忽视的官吏，只见身高七尺，挺拔英俊，眉宇间英气勃发，让人一眼望去心生敬畏，但看官服上的补子，绣着一只鸳鸯，是七品官服。
方从哲抬起手来一指，问道：“你是何人，为何不走？”
此人施礼拜道：“下官刑部员外郎洪承畴。”
“哦，”方从哲眉头一皱，又问道：“你有何事？”
“下官无事，见到首辅愁眉不展，心事重重，恐祸事不远，在此愿为首辅解忧。”洪承畴躬身说道。
方从哲一听，顿时脸色大变，怒道：“休要胡说！本辅有何祸事！你口出繆言，竟如此无礼！”
洪承畴不惊不乱，只是坦然微笑，道：“首辅大人辞官归乡不就是要避祸吗？群臣规劝，皇上不准，您已进退两难。”洪承畴又鞠了一躬，挺身双手交叉放在腹前，说：“首辅如要避祸，何不推心置腹，下官或许可助首辅微薄之力。”
方从哲骇然无语，此人话中虽有些不敬，但却正中心思。此人深解其意，他官卑位低却眼光如炬，说不定是年少俊才，不乏高见，听听他怎么说也无妨。于是，方从哲露出笑容，礼贤下士向洪承畴深深的鞠一躬，“百官之中还有你这样的俊才，我没有发现，是我的失察，还望您多多见谅。”
洪承畴谦谦回礼，“不敢，折煞小人了。”
方从哲伸手礼让洪承畴，让他坐下，又命人上一盏茶，关好门窗，虚心讨教道：“你说的不错，老夫确有此担心。”方从哲收敛笑容，扶膝慨道：“老夫糊涂呀，皇上是咱看大的，从小便凸显雄风，文韬武略，有太、成二祖遗风。皇上虽年方十六，却年少志高，刚刚登基便革除弊政，锐意进取，重振大明。老夫不识时务，百般阻扰，群臣又罢朝逼宫，做出如此悖逆之事，老夫身为首辅难逃其责，皇帝必会怀恨在心伺机清除，若不早退，将来恐遭横祸。”
洪承畴点头称是，进言道：“皇上新登基设立军机枢密处，整饬内廷，废司礼监，裁并司局，收拢皇权，下一步必是整顿内阁，澄清吏治。先前皇上清丈田亩，赋税改革，触动了功勋豪绅的利益，激起满朝文武反抗，进而有百官罢朝逼宫之事。这件事表面上看是皇上退让了，殊不知皇上养精蓄锐，待戈一击，那时将是人头落地一片。”
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